Data fra den siste 2016-folketellingen viser at om 76% av Puerto Ricans er fra den hvite etniske gruppen, som oversetter til mer enn 2.82 millioner mennesker. Puerto Ricans av afrikansk arv utgjør den nest største etniske gruppen i Puerto Rico, som regner med 12.4% av den totale befolkningen. Blandet løpet er den tredje største gruppen, med over 122,000-personer som identifiserer seg som minst to løp. Mixed Race-gruppen er etterfulgt av amerikanske indiske og asiatiske etniske grupper, som står for henholdsvis 0.5% og 0.2% av alle Puerto Ricans. Native Hawaiians er det minste etniske segmentet i Puerto Rico, da de kun er 370 totalt, tilsvarende 0.1% av den totale befolkningen. Om 290,000 Puerto Ricans identifiserer seg som "fra andre raser", som tilsvarer omtrent 8% av den totale befolkningen.
Opprinnelig etnisk gruppe: Taino
De opprinnelige beboerne i Puerto Rico ble kjent som Taino-indianere som bebodd øyene i århundrer. Den etniske gruppen var den eneste etniske gruppen i Puerto Rico i hundrevis av år, inntil Europas ankomst i 16th century. En folketelling i 1765 viste at 49.6% av Puerto Rico-innbyggerne var "andre raser", som var den dominerende etniske gruppen av tiden. Ankomsten av de tidlige spanske bosetterne signaliserte nedgangen i Taino, da de tok med seg sykdommer som Tainos ikke hadde noe forsvar på, for eksempel influensa, kyllingpokker og meslinger. Disse sykdommene slettet nesten Tainos i Puerto Rico, og de hvite spanjolene ble til Puerto Ricos nye dominerende etniske gruppe.
Afrikanske slaver
Den svarte etniske gruppen eller Puerto Ricans av afrikansk forfed stammer enten fra slaver eller frie slaver. Siden okkupasjonen av Puerto Rico hadde Spania innført afrikanske slaver til å jobbe i gårder på øyene. Ved det 16th århundre dro afrikanske slaver inn i øyene i tusenvis. En 1791 slaveopprør i nabostaten St. Domingue (dagens Haiti) så mange franske folk som bosatte seg i Puerto Rico, da de kom unna uroen som fulgte.
