Både aper og aper tilhører familien til primater, noe som betyr at de deler fellesfunksjoner med andre primater, for eksempel fremadvendte øyne, svært fleksible lemmer (armer og ben) og fingerfinger. Mennesker er primater. Apekatter og apekatter deler forvirrende likheter inkluderer deres ansiktsegenskaper og en nærvær av kort, tett hår som dekker hele kroppen, bortsett fra ansiktet.
Det er imidlertid betydelige forskjeller som skiller apen fra apen når mer intrikate fysiske egenskaper og deres oppfattede mentale evner vurderes.
Tilstedeværelse eller fravær av en hale
Den mest forskjellig fysiske forskjellen mellom apen og apen er tilstedeværelsen av en hale. Mens de fleste apearter har lange, fleksible haler på dem, har apefamilien ingen synlig hale.
Beinstruktur og bevegelser
Andre fysiske forskjeller er gjenkjennelige fra kropps- og skjelettstrukturer. Apen har en større kroppsstruktur enn de fleste apearter og antar en mer oppreist holdning, selv om den pleier å bruke sine knokler for å støtte vekten mens de går på bakken. Apenes struktur, derimot, dannes i en typisk kvadrupedalstilling, ligner andre firefotede dyr som katter og hunder, og de beveger seg på alle fire på samme måte. Apenes øvre lemmer er lengre enn de nedre, med skuldre som er synlige sterke og fleksible. Apenes armer rager helt ut i albuen, og håndleddene og underarmene kan oppnå et stort spekter av bevegelser.
Apekatter har derimot mindre smale skuldre. Akkurat i motsetning til sine ape-kolleger, kan apenes armer ikke rette seg helt ut i albuen, og de har begrenset bevegelse av armlene underarmene. Disse kropps- og skjelettvarianter avgjør deres lokomotoriske systemer og hvor forskjellig de beveger seg, spesielt i trær der de for det meste lever. Mens aper kan svinge fra grenen til grenen, støttet av deres overkroppsstyrke og tilrettelagt av deres fleksible skuldre, forben og dexterøse håndleddene, kan aper ikke svinge på denne måten. I stedet har aper en tendens til å løpe langs toppen av grener ved å hoppe, i stedet for å svinge. Apen bruker alle sine fire til å henge på grener, assistert av halen, som også bidrar til balanse.
Hjernestørrelse og livsspann
Vitenskapelige studier har kjøpt ut andre tallrike fakta som skiller apen fra apen. For eksempel er hjernestørrelsen på en ape større enn den av apen. Apene lever også to ganger så lenge aper gjør, og når opp til 60 år.
Intellektuelle evner
Når det gjelder intellektuelle evner, oppfattes aper å være bedre enn aper, som har høyere kognitive ferdigheter og et mer komplekst sosialt atferdssystem. Et klart eksempel på denne kognitive forskjellen er observert i apenes evne til å lage og bruke verktøy for mutterbryte, jakte og leke. Et slikt potensial har ikke blitt sett hos aper. Faktisk plasserer vitenskapsteorier som støtter evolusjonen apen mye høyere opp på den evolusjonære skala enn apen, på grunn av apen er nærmere sammenligning med menneskets art.
